Shuuji e Chise são alunos do terceiro ano de uma escola secundária em Hokkaido. A tímida Chise finalmente está confessando a Shuuji, e finalmente os dois estão começando a trocar o diário de maneira desajeitada. Um dia, Shuuji tenta escapar de um súbito ataque aéreo inimigo em Sapporo. Enquanto escapa desesperadamente do ataque aéreo, Shuuji vê uma cena que ele não poderia esquecer por sua vida. Ele vê Chise, com uma arma enorme parecendo fazer parte da mão dela, atirando nos combatentes inimigos, um por um. Aparentemente, Chise é a arma definitiva com poder destrutivo, importante para a guerra.