Onmyouji conta a história do renomado onmyouji Abe no Seimei, que conhece e faz amizade com o desajeitado nobre da corte Minamoto no Hiromasa. Juntos, eles defendem o kyou da capital Heian de um onmyouji adversário, Douman, que está secretamente planejando a morte do imperador.