No ano de 2015, o mundo está à beira da destruição. A última esperança da humanidade está nas mãos de Nerv, uma agência especial sob as Nações Unidas, e seus Evangelions, máquinas gigantes capazes de derrotar os anjos que anunciam a ruína da Terra. Gendou Ikari, chefe da organização, procura pilotos compatíveis que possam se sincronizar com os Evangelions e realizar seu verdadeiro potencial. Ajudando nesse esforço defensivo estão talentosos Misato Katsuragi, Chefe de Operações Táticas, e Ritsuko Akagi, Cientista Chefe. Cara a cara com seu pai pela primeira vez em anos, a vida média de Shinji Ikari, de 14 anos, é irreversivelmente alterada quando ele é levado às profundezas de Nerv e a um destino novo e angustiante - ele deve se tornar o piloto de Evangelion Unidade 01 com o destino da humanidade em seus ombros. Escrito por Hideaki Anno, Neon Genesis Evangelion é um conto heróico de um jovem garoto que se tornará uma lenda. Mas à medida que esse drama psicológico se desenrola, segredos antigos sob o quadro geral começam a borbulhar para a superfície ...