No ano de 2045, após um desastre econômico conhecido como Padrão Global Sincronizado, o rápido desenvolvimento da IA impulsionou o mundo a entrar em um estado de “Guerra Sustentável”. No entanto, o público não está ciente da ameaça que a IA representa para a raça humana. O cyborg de corpo inteiro Major Motoko Kusanagi e seu segundo em comando Batou são ex-membros da Seção 9 de Segurança Pública, que agora são mercenários contratados viajando na devastada costa oeste americana. Esta terra está cheia de oportunidades para o major e sua equipe, eles utilizam seus cérebros cibernéticos aprimorados e habilidades de combate de seu tempo trabalhando na Seção 9. No entanto, as coisas se complicam com o surgimento de pós-humanos, que têm inteligência e poderes físicos extremos . Os membros da Seção 9 voltam a se reunir para enfrentar esta nova ameaça.