É difícil dominar o mundo, e o enigmático Il Palazzo, chefe da organização ACROSS, sabe disso, então ele pretende começar pequeno conquistando a cidade de Fukuoka. Dois jovens oficiais, o Excel e seu parceiro Hyatt, têm a tarefa de executar esse plano, mas estão no caminho os trabalhadores da Segurança da Cidade, um grupo composto por três homens normais, uma garota muito severa e alguns robôs. Independentemente da simplicidade, Excel e Hyatt sempre conseguem estragar suas missões, o que geralmente resulta em morte e muita destruição. Heppoko Jikken Animation Excel ♥ Saga narra os elaborados problemas em que os policiais do ACROSS se metem, já que Excel e Hyatt nunca deixam de fazer seu trabalho de forma inadequada.